Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHX8Q68G74 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LHX8Q68G74 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LHX8Q68G74 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LHX8Q68G74 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms