Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOCADQ5VW36 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms