Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACHD1Q5VU97 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACHD1Q5VU97 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms