Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC38Q5VT99 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC38Q5VT99 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms