Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM78Q5T7P6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM78Q5T7P6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms