Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP2LQ5T4T6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP2LQ5T4T6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms