Protein–RNA interactions for Protein: Q5T160

RARS2, Probable arginine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARS2Q5T160 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARS2Q5T160 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARS2Q5T160 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms