Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO47Q5MNV8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO47Q5MNV8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO47Q5MNV8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO47Q5MNV8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms