Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRT3Q5FWE3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRT3Q5FWE3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms