Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CMPK2Q5EBM0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms