Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf116Q5BN46 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms