Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC92Q53HC0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms