Protein–RNA interactions for Protein: Q53EP0

FNDC3B, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3BQ53EP0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNDC3BQ53EP0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC3BQ53EP0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC3BQ53EP0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC3BQ53EP0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC3BQ53EP0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms