Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBRG1Q3YBR2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBRG1Q3YBR2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms