Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00303Q3SY05 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LINC00303Q3SY05 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms