Protein–RNA interactions for Protein: Q3LXA3

TKFC, Triokinase/FMN cyclase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TKFCQ3LXA3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TKFCQ3LXA3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TKFCQ3LXA3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TKFCQ3LXA3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms