Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PROX2Q3B8N5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms