Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSR1Q2NL82 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms