Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms