Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPROQ16827 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPROQ16827 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPROQ16827 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
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