Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCBQ16585 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCBQ16585 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms