Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA3Q16281 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA3Q16281 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA3Q16281 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
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