Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHHQ15465 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHHQ15465 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHHQ15465 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SHHQ15465 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHHQ15465 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHHQ15465 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SHHQ15465 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHHQ15465 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHHQ15465 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SHHQ15465 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SHHQ15465 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SHHQ15465 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHHQ15465 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHHQ15465 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHHQ15465 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHHQ15465 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SHHQ15465 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHHQ15465 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHHQ15465 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHHQ15465 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SHHQ15465 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHHQ15465 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHHQ15465 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHHQ15465 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHHQ15465 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHHQ15465 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHHQ15465 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHHQ15465 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHHQ15465 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHHQ15465 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHHQ15465 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHHQ15465 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHHQ15465 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHHQ15465 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHHQ15465 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHHQ15465 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SHHQ15465 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHHQ15465 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHHQ15465 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHHQ15465 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHHQ15465 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHHQ15465 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHHQ15465 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHHQ15465 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHHQ15465 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SHHQ15465 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHHQ15465 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHHQ15465 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SHHQ15465 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SHHQ15465 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHHQ15465 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SHHQ15465 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHHQ15465 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHHQ15465 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHHQ15465 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHHQ15465 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHHQ15465 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHHQ15465 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHHQ15465 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHHQ15465 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHHQ15465 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHHQ15465 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHHQ15465 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SHHQ15465 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHHQ15465 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHHQ15465 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHHQ15465 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHHQ15465 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHHQ15465 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHHQ15465 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHHQ15465 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHHQ15465 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHHQ15465 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHHQ15465 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHHQ15465 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHHQ15465 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHHQ15465 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHHQ15465 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHHQ15465 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHHQ15465 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHHQ15465 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHHQ15465 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHHQ15465 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHHQ15465 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SHHQ15465 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHHQ15465 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHHQ15465 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHHQ15465 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHHQ15465 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHHQ15465 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHHQ15465 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHHQ15465 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHHQ15465 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHHQ15465 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHHQ15465 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHHQ15465 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHHQ15465 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHHQ15465 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SHHQ15465 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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