Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SHPRHQ149N8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHPRHQ149N8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SHPRHQ149N8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SHPRHQ149N8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms