Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN2CQ14957 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIN2CQ14957 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2CQ14957 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms