Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC1AQ14683 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
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