Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CIRBPQ14011 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIRBPQ14011 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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