Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBA3CQ13748 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBA3CQ13748 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
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