Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P11Q13670 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P11Q13670 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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