Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL49Q13405 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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