Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB3BPQ13352 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGB3BPQ13352 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB3BPQ13352 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
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