Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.263e-12■■■■■ 40.1
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PABPC4Q13310 RFC4-207ENST00000433496 1111 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 40.1
PABPC4Q13310 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.983e-12■■■■■ 40.1
PABPC4Q13310 RFC4-204ENST00000417876 479 ntTSL 27.31□□□□□ -1.241e-8■■■■■ 40.1
PABPC4Q13310 RFC4-212ENST00000479307 1043 ntTSL 27.09□□□□□ -1.271e-8■■■■■ 40.1
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PABPC4Q13310 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 40.1
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PABPC4Q13310 MCRIP2-203ENST00000491999 1050 ntTSL 526.93■■□□□ 1.97e-9■■■■■ 40.1
PABPC4Q13310 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.987e-9■■■■■ 40.1
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PABPC4Q13310 GRB10-203ENST00000398810 4785 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 40
PABPC4Q13310 GRB10-204ENST00000398812 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 40
PABPC4Q13310 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 40
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PABPC4Q13310 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.323e-9■■■■■ 39.9
PABPC4Q13310 SCYL1-215ENST00000534462 579 ntTSL 322.03■■□□□ 1.123e-9■■■■■ 39.9
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PABPC4Q13310 GLMP-208ENST00000481050 684 ntTSL 321.78■■□□□ 1.083e-9■■■■■ 39.9
PABPC4Q13310 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.853e-9■■■■■ 39.9
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PABPC4Q13310 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.813e-9■■■■■ 39.9
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PABPC4Q13310 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.732e-17■■■■■ 39.9
PABPC4Q13310 GLMP-203ENST00000461597 658 ntTSL 319.23■□□□□ 0.673e-9■■■■■ 39.9
PABPC4Q13310 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 39.9
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PABPC4Q13310 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.443e-9■■■■■ 39.9
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PABPC4Q13310 GLMP-204ENST00000472870 1188 ntTSL 517.14■□□□□ 0.333e-9■■■■■ 39.9
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PABPC4Q13310 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.063e-9■■■■■ 39.9
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PABPC4Q13310 GLMP-209ENST00000482579 572 ntTSL 314.58□□□□□ -0.083e-9■■■■■ 39.9
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PABPC4Q13310 TCTN3-203ENST00000371217 2514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.683e-9■■■■■ 39.9
PABPC4Q13310 TCTN3-207ENST00000614499 2739 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 39.9
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PABPC4Q13310 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.443e-9■■■■■ 39.9
PABPC4Q13310 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.247e-7■■■■■ 39.8
PABPC4Q13310 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.057e-7■■■■■ 39.8
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PABPC4Q13310 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.614e-21■■■■■ 39.7
PABPC4Q13310 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.454e-21■■■■■ 39.7
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PABPC4Q13310 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC8.13□□□□□ -1.112e-87■■■■■ 39.7
PABPC4Q13310 RPS5-208ENST00000599909 523 ntTSL 213.76□□□□□ -0.211e-24■■■■■ 39.6
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PABPC4Q13310 CHKA-203ENST00000525155 1201 ntTSL 514.66□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 39.6
PABPC4Q13310 CHKA-207ENST00000533728 662 ntTSL 210.6□□□□□ -0.715e-7■■■■■ 39.6
PABPC4Q13310 NDUFA3-210ENST00000471292 646 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.381e-12■■■■■ 39.6
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PABPC4Q13310 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.071e-10■■■■■ 39.6
PABPC4Q13310 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.134e-11■■■■■ 39.5
PABPC4Q13310 MRPL47-202ENST00000392659 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 39.5
PABPC4Q13310 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.781e-7■■■■■ 39.4
PABPC4Q13310 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.363e-11■■■■■ 39.4
PABPC4Q13310 KCTD15-204ENST00000587658 632 ntTSL 328.79■■■□□ 2.23e-11■■■■■ 39.4
PABPC4Q13310 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.633e-11■■■■■ 39.4
PABPC4Q13310 KCTD15-205ENST00000588637 571 ntTSL 521.48■■□□□ 1.033e-11■■■■■ 39.4
PABPC4Q13310 KCTD15-209ENST00000590771 577 ntTSL 319.41■□□□□ 0.73e-11■■■■■ 39.4
PABPC4Q13310 KCTD15-203ENST00000587559 622 ntTSL 418.68■□□□□ 0.583e-11■■■■■ 39.4
PABPC4Q13310 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.273e-11■■■■■ 39.4
PABPC4Q13310 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.765e-9■■■■■ 39.4
PABPC4Q13310 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.735e-9■■■■■ 39.4
PABPC4Q13310 LDHA-220ENST00000542179 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.731e-323■■■■■ 39.3
PABPC4Q13310 FAH-209ENST00000559217 619 ntTSL 212.36□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 39.3
PABPC4Q13310 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.191e-26■■■■■ 39.3
PABPC4Q13310 RRP1B-202ENST00000470886 4634 ntTSL 211.42□□□□□ -0.581e-26■■■■■ 39.3
PABPC4Q13310 MRPL28-207ENST00000461550 1478 ntTSL 521.01■□□□□ 0.951e-8■■■■■ 39.2
PABPC4Q13310 MRPL28-208ENST00000469744 1467 ntTSL 1 (best)21.01■□□□□ 0.951e-8■■■■■ 39.2
PABPC4Q13310 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.921e-8■■■■■ 39.2
PABPC4Q13310 MRPL28-209ENST00000481453 2229 ntTSL 220.38■□□□□ 0.851e-8■■■■■ 39.2
PABPC4Q13310 MRPL28-210ENST00000483764 1512 ntTSL 1 (best)19.56■□□□□ 0.721e-8■■■■■ 39.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.774e-6■■■■■ 39.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.584e-6■■■■■ 39.2
PABPC4Q13310 RAB3IL1-206ENST00000533136 858 ntTSL 218.36■□□□□ 0.534e-6■■■■■ 39.2
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