Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRAF1Q13077 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF1Q13077 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF1Q13077 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
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