Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRN3Q13033 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRN3Q13033 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRN3Q13033 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRN3Q13033 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRN3Q13033 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRN3Q13033 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRN3Q13033 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN3Q13033 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
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