Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRIK3Q13003 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIK3Q13003 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK3Q13003 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
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