Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RASGEF1BQ0VAM2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGEF1BQ0VAM2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASGEF1BQ0VAM2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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