Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHRNDQ07001 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms