Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCZQ05513 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCZQ05513 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms