Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCQQ04759 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCQQ04759 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCQQ04759 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms