Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMX2Q04743 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMX2Q04743 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMX2Q04743 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms