Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 897.4 ms