Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFAIP2Q03169 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP2Q03169 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFAIP2Q03169 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms