Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TGFBR3Q03167 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGFBR3Q03167 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TGFBR3Q03167 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TGFBR3Q03167 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR3Q03167 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR3Q03167 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR3Q03167 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR3Q03167 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR3Q03167 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR3Q03167 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms