Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CREMQ03060 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CREMQ03060 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CREMQ03060 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CREMQ03060 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREMQ03060 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREMQ03060 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREMQ03060 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREMQ03060 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREMQ03060 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREMQ03060 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREMQ03060 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREMQ03060 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREMQ03060 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREMQ03060 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREMQ03060 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREMQ03060 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CREMQ03060 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREMQ03060 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREMQ03060 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREMQ03060 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREMQ03060 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREMQ03060 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREMQ03060 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREMQ03060 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREMQ03060 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREMQ03060 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CREMQ03060 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREMQ03060 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREMQ03060 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREMQ03060 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREMQ03060 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREMQ03060 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREMQ03060 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREMQ03060 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREMQ03060 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREMQ03060 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREMQ03060 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREMQ03060 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREMQ03060 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREMQ03060 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREMQ03060 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREMQ03060 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREMQ03060 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREMQ03060 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREMQ03060 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREMQ03060 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREMQ03060 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREMQ03060 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREMQ03060 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREMQ03060 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREMQ03060 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREMQ03060 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREMQ03060 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREMQ03060 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREMQ03060 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREMQ03060 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREMQ03060 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREMQ03060 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREMQ03060 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREMQ03060 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREMQ03060 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREMQ03060 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREMQ03060 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREMQ03060 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CREMQ03060 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CREMQ03060 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREMQ03060 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREMQ03060 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREMQ03060 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CREMQ03060 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CREMQ03060 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREMQ03060 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREMQ03060 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREMQ03060 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREMQ03060 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREMQ03060 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREMQ03060 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREMQ03060 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREMQ03060 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREMQ03060 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREMQ03060 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREMQ03060 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREMQ03060 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREMQ03060 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREMQ03060 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREMQ03060 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREMQ03060 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREMQ03060 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CREMQ03060 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CREMQ03060 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CREMQ03060 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CREMQ03060 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREMQ03060 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREMQ03060 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREMQ03060 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREMQ03060 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREMQ03060 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CREMQ03060 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CREMQ03060 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms