Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SP4Q02446 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SP4Q02446 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SP4Q02446 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SP4Q02446 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SP4Q02446 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SP4Q02446 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SP4Q02446 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SP4Q02446 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SP4Q02446 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SP4Q02446 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SP4Q02446 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SP4Q02446 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SP4Q02446 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP4Q02446 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP4Q02446 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP4Q02446 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP4Q02446 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP4Q02446 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP4Q02446 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP4Q02446 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SP4Q02446 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SP4Q02446 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SP4Q02446 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SP4Q02446 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SP4Q02446 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SP4Q02446 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SP4Q02446 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SP4Q02446 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SP4Q02446 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SP4Q02446 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SP4Q02446 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SP4Q02446 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SP4Q02446 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SP4Q02446 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SP4Q02446 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SP4Q02446 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SP4Q02446 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SP4Q02446 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SP4Q02446 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SP4Q02446 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SP4Q02446 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SP4Q02446 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SP4Q02446 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP4Q02446 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP4Q02446 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP4Q02446 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP4Q02446 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP4Q02446 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP4Q02446 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SP4Q02446 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP4Q02446 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP4Q02446 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP4Q02446 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP4Q02446 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP4Q02446 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP4Q02446 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SP4Q02446 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SP4Q02446 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SP4Q02446 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SP4Q02446 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SP4Q02446 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SP4Q02446 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SP4Q02446 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SP4Q02446 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SP4Q02446 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP4Q02446 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP4Q02446 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP4Q02446 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP4Q02446 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP4Q02446 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP4Q02446 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SP4Q02446 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SP4Q02446 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SP4Q02446 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SP4Q02446 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SP4Q02446 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SP4Q02446 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SP4Q02446 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SP4Q02446 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SP4Q02446 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SP4Q02446 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SP4Q02446 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SP4Q02446 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SP4Q02446 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SP4Q02446 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SP4Q02446 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SP4Q02446 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SP4Q02446 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SP4Q02446 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SP4Q02446 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SP4Q02446 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SP4Q02446 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SP4Q02446 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SP4Q02446 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SP4Q02446 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SP4Q02446 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SP4Q02446 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SP4Q02446 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SP4Q02446 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms