Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKOR1P84550 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SKOR1P84550 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SKOR1P84550 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms