Protein–RNA interactions for Protein: P84077

ARF1, ADP-ribosylation factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1P84077 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARF1P84077 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARF1P84077 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARF1P84077 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARF1P84077 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARF1P84077 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ARF1P84077 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARF1P84077 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARF1P84077 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARF1P84077 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARF1P84077 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARF1P84077 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARF1P84077 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARF1P84077 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARF1P84077 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ARF1P84077 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ARF1P84077 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARF1P84077 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARF1P84077 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARF1P84077 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARF1P84077 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARF1P84077 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARF1P84077 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARF1P84077 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ARF1P84077 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARF1P84077 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARF1P84077 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARF1P84077 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF1P84077 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF1P84077 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF1P84077 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF1P84077 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF1P84077 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF1P84077 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF1P84077 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF1P84077 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF1P84077 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARF1P84077 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARF1P84077 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARF1P84077 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARF1P84077 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARF1P84077 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARF1P84077 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARF1P84077 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARF1P84077 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARF1P84077 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARF1P84077 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARF1P84077 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARF1P84077 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARF1P84077 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARF1P84077 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARF1P84077 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARF1P84077 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARF1P84077 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF1P84077 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF1P84077 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF1P84077 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF1P84077 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF1P84077 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF1P84077 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF1P84077 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF1P84077 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF1P84077 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF1P84077 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ARF1P84077 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARF1P84077 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARF1P84077 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARF1P84077 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARF1P84077 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARF1P84077 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARF1P84077 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARF1P84077 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARF1P84077 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARF1P84077 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARF1P84077 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARF1P84077 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARF1P84077 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARF1P84077 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARF1P84077 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARF1P84077 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARF1P84077 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARF1P84077 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARF1P84077 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARF1P84077 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARF1P84077 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARF1P84077 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARF1P84077 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARF1P84077 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARF1P84077 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF1P84077 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF1P84077 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF1P84077 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF1P84077 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF1P84077 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF1P84077 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF1P84077 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF1P84077 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF1P84077 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF1P84077 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF1P84077 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms