Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUCB2P80303 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms