Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HBA1P69905 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HBA1P69905 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HBA1P69905 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HBA1P69905 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HBA1P69905 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HBA1P69905 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HBA1P69905 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HBA1P69905 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HBA1P69905 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HBA1P69905 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HBA1P69905 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HBA1P69905 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HBA1P69905 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HBA1P69905 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HBA1P69905 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HBA1P69905 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HBA1P69905 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HBA1P69905 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HBA1P69905 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HBA1P69905 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HBA1P69905 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HBA1P69905 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HBA1P69905 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HBA1P69905 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HBA1P69905 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HBA1P69905 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HBA1P69905 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HBA1P69905 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HBA1P69905 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HBA1P69905 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HBA1P69905 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HBA1P69905 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HBA1P69905 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HBA1P69905 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HBA1P69905 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HBA1P69905 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HBA1P69905 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HBA1P69905 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HBA1P69905 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HBA1P69905 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HBA1P69905 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HBA1P69905 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HBA1P69905 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HBA1P69905 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HBA1P69905 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HBA1P69905 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HBA1P69905 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HBA1P69905 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HBA1P69905 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HBA1P69905 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HBA1P69905 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HBA1P69905 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HBA1P69905 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HBA1P69905 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HBA1P69905 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HBA1P69905 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HBA1P69905 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HBA1P69905 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HBA1P69905 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HBA1P69905 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HBA1P69905 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HBA1P69905 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HBA1P69905 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HBA1P69905 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HBA1P69905 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HBA1P69905 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HBA1P69905 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HBA1P69905 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HBA1P69905 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HBA1P69905 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HBA1P69905 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HBA1P69905 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HBA1P69905 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HBA1P69905 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HBA1P69905 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HBA1P69905 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HBA1P69905 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HBA1P69905 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HBA1P69905 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HBA1P69905 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HBA1P69905 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HBA1P69905 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HBA1P69905 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HBA1P69905 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HBA1P69905 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HBA1P69905 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HBA1P69905 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HBA1P69905 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HBA1P69905 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HBA1P69905 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HBA1P69905 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HBA1P69905 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HBA1P69905 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HBA1P69905 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HBA1P69905 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HBA1P69905 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HBA1P69905 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HBA1P69905 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HBA1P69905 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms