Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNC1P63316 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNC1P63316 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNC1P63316 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms